У меня есть виртуальная среда, давайте назовем ее virtenv.
После ее активации (workon virtenv), выполнение pip list или pip freeze показывает сравнительно короткий список пакетов.
Запуск which pip показывает ~/bin/pip.
При входе в каталог виртуальных пакетов envs (~/.../virtual_envs/virtenv/lib/python2.7/site-packages), pip list и pip freeze показывают гораздо более длинный и более обширный список пакетов.
Запуск which pip по-прежнему показывает ~/bin/pip.
Поскольку в обоих случаях я нахожусь в одной и той же активированной среде, и запускается один и тот же pip, не должен списки будут одинаковыми?
РЕДАКТИРОВАТЬ: решено. Этот файл: ~/.pydistutils.cfg заставлял pip всегда запускаться с ~/bin/pip, что испортило виртуальную среду.