Вы можете скрыть основной график и просто отобразить навигатор: https://jsfiddle.net/bqhz2fwn/
Единственные изменения, которые я внес в вашу скрипку, заключались в том, чтобы скрыть ось X и задать высоту оси Y 0:
"xAxis": {
"categories": [
1996,
1997,
1998,
1999,
2000,
2001,
2002,
2003,
2004,
2005,
2006,
2007,
2008,
2009,
2010,
2011,
2012,
2013,
2014,
2015,
2016
],
lineWidth: 0,
tickLength: 0,
labels: {
enabled: false
}
},
yAxis: {
height: 0,
gridLineWidth: 0,
labels: {
enabled: false
}
},
А затем увеличьте высоту навигатора, чтобы заполнить пространство:
"navigator": {
height: 275,