Полагаю, это потому, что во время отладки gdb пытается собрать весь стек вызовов, но по некоторым причинам, например, например, вы не запускаете VS Code под root (и, очевидно, вам не нужно, но некоторые libs находятся в каталогах root и не могут быть доступны для пользовательского приложения) или поскольку для работы в системе требуются libs, но они являются просто скомпилированными двоичными файлами без исходного кода, VS Code не может показать вам содержимое этих файлов. Это не ошибки процесса отладки или неправильной работы вашего кода, это просто ошибки VS Code и они не имеют значения.