Вы можете сделать ниже, и он будет использовать все столбцы, кроме индекса и построить график.
abs_data.set_index('fluorophore ').plot()
Если вы хотите отфильтровать значения для флуорофора, вы можете сделать это
abs_data[abs_data.fluorophore .isin(['A', 'B'])].set_index('fluorophore ').plot()