Я опубликую свой комментарий как ответ, так как он слишком длинный для поля комментария.
«Отказано в доступе» ошибки обычно означают, что вызывающий абонент не имеет права Google Облачное разрешение IAM для определенных ресурсов.
При разработке для GAE необходимо проверить, совместимы ли библиотеки, которые вы используете в своем приложении ASP. NET, с GAE и дополнительно разрешить запросы, выполняемые к GAE.
Сохраняется ли документ PDF в базе данных? Если да, имеет ли ваше приложение все разрешения, необходимые для чтения и записи файлов в базу данных?
Не могли бы вы указать свои конфигурации, а также предоставить файл .yaml и соответствующий код вашего приложения для дальнейших разъяснений?