Используя этот код: setServiceProperty("wordLevelConfidence","true", ServicePropertyChannel.UriQueryParameter);
Вот как я это сделал
SpeechConfig config = SpeechConfig.fromSubscription(speechSubscriptionKey, serviceRegion);
config.setServiceProperty("wordLevelConfidence","true", ServicePropertyChannel.UriQueryParameter);
config.setServiceProperty("format", "detailed", ServicePropertyChannel.UriQueryParameter); //you have to do it in this order
И это получить результаты обратно
PropertyCollection properties = result.getProperties();
String property = properties.getProperty(PropertyId.SpeechServiceResponse_JsonResult);