Вы должны попробовать проверить исходный код страницы, которая должна иметь стиль bootstrap:
Go в ваш раздел <head></head>
и проверьте URL, сгенерированный вашим кодом <?php echo base_url(); ?>/assets/css/bootstrap.css
Теперь вы можете попробовать получить доступ сгенерированный URI и рассмотрите возможность его настройки, чтобы получить правильный путь к вашему ресурсу bootstrap.css
!
Это «сложный», но эффективный способ устранения проблем с доступом к ресурсам!
PS: не забудьте Shift + F5 для принудительной перезагрузки кэша (по крайней мере, для Google Chrom)
Надеюсь, это поможет вам!