У меня есть файл уценки R, который я хотел бы иметь на своем корпоративном сервере Shiny.
Согласно R Уценка: исчерпывающее руководство Я могу добавить runtime: shiny к метаданные YAML вверху файла Rmd, чтобы превратить его в блестящий документ. Я сделал это, и это работает. Если я нажму «Запустить документ» в RStudio, он запустит Rmd, и я увижу отчет без проблем.
Мой проект находится в каталоге ShinyApps, где Shiny Server ищет приложения для обслуживания. , Когда я нажимаю на URL этого проекта, я получаю отчет без диаграмм . Я просто получаю значки с разбитыми изображениями там, где должны быть графики. (Я использую RStudio Server, так что это те же самые файлы, к которым обращаются RStudio и Shiny Server).
R версия 3.4.3, Shiny Server версия 1.5.6.875
ОБНОВЛЕНИЕ: У меня есть воспроизвел поведение на простейшем возможном примере. Я создал новый проект RStudio - простой проект - с именем TEST, расположенный в моем каталоге ShinyApps. Затем я создал новый файл R Markdown, который я назвал TEST.Rmd. Этот файл предварительно заполнен примером RMarkdown с использованием встроенных наборов данных cars и pressure. Я изменил заголовок YAML, чтобы включить runtime: shiny. Кнопка «вязать» RStudio заменяется кнопкой «Запустить документ», как и ожидалось, и нажатие этой кнопки запускает документ и работает как положено. Попытка просмотреть страницу через Shiny Server имеет ту же проблему, при которой сюжет не включен; значок сломанного изображения занимает его место.
ОБНОВЛЕНИЕ 2: По запросу, вот файл уценки. Это буквально пример файла, сгенерированного RStudio с добавлением runtime: shiny в заголовок YAML.
---
title: "Test RMarkdown"
author: "Michael Henry"
date: "4/6/2020"
output: html_document
runtime: shiny
---
```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
```
## R Markdown
This is an R Markdown document. Markdown is a simple formatting syntax for authoring HTML, PDF, and MS Word documents. For more details on using R Markdown see <http://rmarkdown.rstudio.com>.
When you click the **Knit** button a document will be generated that includes both content as well as the output of any embedded R code chunks within the document. You can embed an R code chunk like this:
```{r cars}
summary(cars)
```
## Including Plots
You can also embed plots, for example:
```{r pressure, echo=FALSE}
plot(pressure)
```
Note that the `echo = FALSE` parameter was added to the code chunk to prevent printing of the R code that generated the plot.
ОБНОВЛЕНИЕ 3: Итак, я отправился на поиски файла журнала для Shiny Server. У меня нет никаких привилегий администратора, поэтому я никогда не искал это раньше, но я нашел файл журнала, который включал это: /lib64/libpango-1.0.so.0: undefined symbol: g_log_structured_standard. Оказывается, в RHEL есть ошибка, в которой есть исправление, поэтому я обратился к администратору с просьбой применить исправление. После того, как это будет применено, я сообщу о том, решило ли это мою проблему.
ОБНОВЛЕНИЕ 4: Оказывается, мой RHEL-сервер обновлен; у него уже есть версия glib2, предложенная исправлением. То, что я все еще получаю эту ошибку, - это то, что мой администратор собирается перевести в Red Hat.
ОБНОВЛЕНИЕ 5: Поддержка Red Hat предполагала, что был еще один файл glib2, так что оказалось, что это был случай. Удаление этого файла решило проблему!