Мне бы пришлось проверить это, но похоже, что вы можете использовать переменные окружения в вашем конфигурационном файле следующим образом:
<root>
<level value="${LOGLEVEL}" />
...
</root>
Обновление:
Это не работает для уровня журнала. Вы можете использовать переменные окружения для имени файла приложения, но, очевидно, не для уровня журнала ...