Нет, вы не можете (вы, очевидно, можете запустить его из REPL, хотя, но я предполагаю, что вы не это имели в виду). CIDER опирается на пользовательский тестовый прогон, который является частью его промежуточного программного обеспечения cider-nrepl и тесно интегрируется с остальной функциональностью CIDER. Поскольку CIDER создает собственный пользовательский интерфейс для тестовых запусков, вы все равно мало что получаете от REPL-ориентированных бегунов.
Тем не менее, с Emacs и CIDER все возможно. Если вы хотите создать интеграцию CIDER для eftest, вы можете использовать kaocha-runner в качестве источника вдохновения.