Проблемы при пересчете некоторых изображений CT - PullRequest
0 голосов
/ 09 марта 2020

Я пытался обработать некоторые КТ-изображения и обнаружил проблему при повторной выборке изображений. Я нашел код, который делает то, что я хочу, но я столкнулся с множеством проблем при преобразовании его в python3. Может ли кто-нибудь помочь, пожалуйста:

id = 0
imgs_to_process = np.load(output_path+'fullimages_{}.npy'.format(id))
def resample(image, scan, new_spacing=[1,1,1]):
    # Determine current pixel spacing
    spacing = map(float, ([scan[0].SliceThickness] + scan[0].PixelSpacing))
    spacing = np.array(list(spacing))

    resize_factor = spacing / new_spacing
    new_real_shape = image.shape * resize_factor
    new_shape = np.round(new_real_shape)
    real_resize_factor = new_shape / image.shape
    new_spacing = spacing / real_resize_factor

    image = scipy.ndimage.interpolation.zoom(image, real_resize_factor)

    return image, new_spacing

print "Shape before resampling\t", imgs_to_process.shape
imgs_after_resamp, spacing = resample(imgs_to_process, patient, [1,1,1])
print "Shape after resampling\t", imgs_after_resamp.shape
Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...