Вы можете использовать np.triu_indices()
для эффективного получения индексов верхнего треугольника:
fromScToMt(sc)
# array([ 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 44, 45, 46, 47])
sc[np.triu_indices(n, k=1)].ravel()
# array([ 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 44, 45, 46, 47])