Зависит от того, как выглядят ваши запросы. Если вы сделаете scan
/ query
с фильтрами, то все прочитанные элементы будут стоить, даже если они не будут возвращены.
Если вы выполняете полное сканирование таблицы для регулярной очистки, например, стоит разделить таблицы.
Если вы обращаетесь к своим данным по (индексу) га sh ключу (и ключу сортировки), которые не соответствуют никаким неактивным данным, то это не должно иметь значения.