Отказано в праве на запись таблицы с dbWriteTable в RPostgreSQL - PullRequest
Новая
       58

Отказано в праве на запись таблицы с dbWriteTable в RPostgreSQL

0 голосов
/ 16 февраля 2020

Я уже давно пытаюсь решить проблему с пакетом R PostgreSQL. Мой код: 

path_ene <- "C:/Users/omen03/ENE"

nene <- "ene_2010_02_efm.csv"


drv <- dbDriver("PostgreSQL")

con = dbConnect(drv, user="postgres", password="mypassword",
            host="localhost", port=5432, dbname="ENE")

tn = "ene_2010_02_efm";

dbRemoveTable(con,tn);
dbWriteTable(conn = con, name = tn, value = paste0(path_ene,"/",nene),
                                    sep = ",", overwrite = FALSE))

При выполнении кода, описанного выше, я выдаю следующую ошибку:

Ошибка в postgresqlExecStatement (conn, Statement, ...): RS-DBI драйвер: (не удалось получить результат: ОШИБКА: не удалось открыть файл «C: /Users/omen03/ENE/ene_2010_02_efm.csv» для чтения: В доступе отказано

СОВЕТ : COPY FROM сообщает серверному процессу PostgreSQL о необходимости прочитать файл. Возможно, вы захотите использовать средство на стороне клиента, такое как psql \ copy.) Кроме того: Предупреждение: В postgresqlImportFile (conn, name, value,. ..): не удалось загрузить данные в таблицу

, когда я пытаюсь без указания пути к файлу, мне выдается другая ошибка 

dbRemoveTable(con,tn);
dbWriteTable(conn = con, name = tn, value = nene),
                                    sep = ",", overwrite = FALSE))

Ошибка в postgresqlExecStatement (conn , оператор, ...): Драйвер RS-DBI: (не удалось получить результат: ОШИБКА: не удалось открыть файл «./ ene_2010_02_efm» для чтения: Нет такого файла или каталога

СОВЕТ: COPY FROM сообщает серверному процессу PostgreSQL прочитать файл. Вы можете использовать средство на стороне клиента, такое как psql \ copy. ) Кроме того: Предупреждение: В postgresqlImportFile (conn, name, value, ...): не удалось загрузить данные в таблицу

Обновление:

Принимая во внимание сообщение об ошибке, я решил использовать sql напрямую для вставки значений csv в каждую из таблиц в базе данных. Для этого я использовал пару функций 

createEmptyTable <- function(con,tn,df) {
  sql <- paste0("create table \"",tn,"\" (",paste0(collapse=',','"',names(df),'" ',sapply(df[0,],postgresqlDataType)),");");
  dbSendQuery(con,sql);
  invisible();
};

Взято из: Как написать таблицу в PostgreSQL из R?

и 

#tn: Table name
#c_names: column names of each table (a list) 
#source: The path to each csv files

insert_data = function(tn, source){
  sql = paste0('COPY ',tn,' FROM \'',paste0(path_ene,'\\',source),'\' DELIMITER \',\' CSV HEADER')
  dbSendQuery(con, sql);
}


insert_data(tn[1], paste0(path_ene, "/",nene[1]))

В любом случае, я все еще получаю очень похожую ошибку.

Ошибка в postgresqlExecStatement (conn, Statement, ...): Драйвер RS-DBI: (не удалось получить результат: ОШИБКА: Не удалось открыть файл «C: /Users/omen03/ENE/ene_2010_02_efm.csv» для чтения: Отказано в разрешении ПОДСКАЗКА: COPY FROM сообщает серверу PostgreSQL процесс чтения файла. Возможно, вы захотите использовать клиент- вспомогательные средства, такие как psql \ copy.)

Информация о моем сеансе:

R версия 3.6.1 (2019-07-05) Платформа: x86_64-w64-mingw32 / x64 (64-разрядная версия) Работает в: Windows 10 x64 (сборка 18362)

Продукты матрицы: по умолчанию

языковой стандарт: [1] LC_COLLATE = Spanish_Chile.1252 LC_CTYPE = Spanish_Chile.1252 LC_MONETARY = Spanish_Chile.1252 LC_NUMERIC = C [5] LC_TIME = Spanish_Chile.1252

прикрепленные базовые пакеты: [1] stats grap hics grDevices использует
база методов наборов данных

другие прикрепленные пакеты: [1] RPostgreSQL_0.6-2 DBI_1.0.0
foreign_0.8-71 captioner_2.2.3 kableExtra_1.1.0 wordcloud_2.6 tidytext_0.2.2 gridExtra_2.3 [9] gtable_0.3.0
readstata13_0.9.2 RColorBrewer_1.1-2 ggrepel_0.8.1 pbapply_1.4-2 srvyr_0.3.6 data.table_1.12.6 lubridate_1.7.4 [17] stringi_1.4.3 forcats_0.4.0 stringcats_1.4.0 строка 4.0 dplyr_0.8.3
purrr_0.3.3 readr_1.3.1 tidyr_1.0.0 tibble_2.1.3 [25] ggplot2_3.2.1 tidyverse_1.3.0

загружено через пространство имен (и не подключено): [1] httr_1.4.1
jsonlite_1.6 viridisLite_0.3.0 splines_3.6.1 modelr_0.1.5
assertthat_0.2.1 cellranger_1.1.0 sessioninfo_1.1.1 [9] pillar_1.4.3 backports_1.1.5 lattice_0.20-38 glue_1.3.1
digest_0.6.23 rvest_0.3.5 colorspace_1.4-1 htmltools_0.4.0 [17] Matrix_1.2-17 survey_3.36 pkgconfig_2.0.3 метла_0.5.2 haven_2.2.0 scale_1.1.0 webshot_0.5.2 generics_0.0.2
[25] withr_2.1.2 lazyeval_0 .2.2 cli_2.0.0
выживание_2.44-1. 1 magrittr_1.5 crayon_1.3.4 readxl_1.3.1
valu_0.14 [33] tokenizers_0.2.1 janeaustenr_0.1.5 fs_1.3.1
fansi_0.4.0 nlme_3.1-140 SnowballC_0.6.0 xml2_1.2. 2
tools_3.6.1 [41] hms_0.5.2 mitools_2.4
lifecycle_0.1.0 munsell_0.5.0prex_0.3.0 compiler_3.6.1
rlang_0.4.2 grid_3.6.1 [49] rstudioapi_0.10
rmarkdown_1 .18 R6_2.4.1 knitr_1.26 zeallot_0.1.0
parallel_3.6.1 Rcpp_1.0.3 vctrs_0.2.1 [57] dbplyr_1.4.2 tidyselect_0.2.5 xfun_0.11

1 Ответ

0 голосов
/ 17 февраля 2020

Наконец, я нашел ответ, ища проблему прямого импорта данных в postgresql. Этого было достаточно, чтобы изменить конфигурацию папки, содержащей файлы .csv.

Я воспроизводил этот ответ , который я наконец использовал.

  • Щелкните правой кнопкой мыши папку, содержащую файл (ы) данных, в разрешении которых было отказано, и выберите «Свойства».
  • В окне свойств папки перейдите на вкладку «Безопасность».
  • Нажмите кнопку «Изменить» , В открывшемся окне «Разрешения для папки» нажмите кнопку «Добавить ...».
  • Введите Every в текстовое поле «Введите имена объектов для выбора».
  • Нажмите OK, и окно закроется.
...