Fancybox добавляет fancybox-content
имя класса к содержимому, чтобы добавить некоторые необходимые CSS свойства и некоторые стили по умолчанию, например, белый цвет фона, отступы.
Поэтому вы просто переопределяете эти правила, например:
.fancybox-content.red {
background: red;
padding: 10px 20px;
}