Я работаю над приложением Shiny, которое генерирует различные графики и позволяет пользователям изменять параметры графика. Для этого я использую комбинацию функций selectInput, numericInput и checkboxInput после графика (conditionalPanel). Я упаковал код так, чтобы data.frame, используемый для графика, вычислялся реактивно (чтобы обеспечить гибкую поднаборку перед построением графика). Все отлично работает, но когда я хочу обновить некоторые графические параметры (например, цвета для использования через selectInput), код ломается, потому что он оценивается преждевременно, прежде чем я выберу все необходимые цвета (то есть, когда нужно 4 цвета, код ломается сразу после выбора первого цвета).
Я знаю о debounce функции, чтобы задержать оценку, но я не хочу использовать ее, потому что:
- Мне нравится мгновение изменения в графике при обновлении других параметров
- Выбор цветов может занять некоторое время, поэтому трудно установить заранее заданный интервал времени / времени задержки
Одним из решений может быть добавьте условное обозначение actionButton (вместе с другими графическими параметрами) для регулирования срабатывания значений реактивного входа (см. ниже). Это не идеально, потому что после изменения параметров мне нужно нажать на обновление, чтобы обновить график. Кроме того, я не уверен, как это будет работать, потому что km_graph уже является реактивным объектом графика. В качестве альтернативы, есть ли решение для регулирования selectInput специально, чтобы до тех пор, пока все цвета не были выбраны, оно не оценивалось?
Я прочитал несколько постов по этой проблеме, но не смог найти решение, которое работает с дизайн моего кода. Я попытаюсь написать разделы моих ui и server, чтобы дать представление о том, что я пытаюсь сделать:
ui.R
# ...
mainPanel(
plotOutput("km_graph"),
# Conditional panel prompted only after the km_graph is generated
conditionalPanel(
condition = "output.km_graph" ,
checkboxInput("km_risk", label="Show risk table", F),
selectInput("km_medline", label = "Mark median survival",
selected = "hv",
choices = c("None" = "none",
"Horizontal-Vertical" = "hv",
"Vertical" = "v",
"Horizontal" = "h")),
sliderInput("km_xlim", label="days", value = 6000, min = 10, max=10000),
selectInput("km_pal", "Select colors", multiple = T,
selectize = T,
selected = "jco",
choices = list(`Pre-made palettes` = list("npg","aaas", "lancet", "jco",
"ucscgb", "UChicago",
"simpsons", "rickandmorty")
`Individual colors` = as.list(color_choices))
)
# Need to find a way to prevent evaluating before all the colors are selected for km_pal
# Maybe another actionButton() here to update graph after all the parameters are selected?
server.R
#...
# km_results() is the reactive object containing survival analysis results
# km_dat() is the reactive data frame used in the analyses
output$km_graph <- renderPlot({
survminer::ggsurvplot(km_results(), data = km_dat(),
pval = input$km_pval,
pval.method = input$km_pval,
risk.table = input$km_risk,
conf.int = input$km_confint,
surv.median.line = input$km_medline,
break.time.by = input$km_breaktime,
legend="right",
xlim=c(0, input$km_xlim),
palette = input$km_pal) ###### This breaks due to premature evaluation
})
Полный представитель
shinyApp(
ui = basicPage(
selectInput("dat", "Select data",
selected = "iris", choices = c("iris")),
actionButton("go", "Go!"),
plotOutput("plot"),
conditionalPanel(
h3("graphing options"),
condition = "output.plot",
checkboxInput("plot_point", "Show points", T),
selectizeInput("plot_colors", "Select colors", selected="jco",
choices = list(`premade`=list("jco", "npg"),
`manual`=list("red", "black", "blue")))
)
),
server = function(input, output) {
dat <- reactive({
if(input$dat == "iris") iris
})
output$plot <- renderPlot({
req(input$go)
ggpubr::ggscatter(dat(), "Sepal.Length", "Sepal.Width",
color="Species", palette=input$plot_colors)
})
}
)
Спасибо за понимание!