Я думаю, что нужна дополнительная информация для решения этой проблемы, например sql log.
По моему мнению, ваше утверждение состоит в том, что вы вставляете огромные данные, а сервер имеет неправильную конфигурацию, или ваш запрос должен быть разделен для решения. этот вопрос.