Просто чтобы помочь другим с этой же проблемой.
Вы должны изменить правило «Нет SameSite», чтобы также проверить наличие «безопасного» флага. Например:
<add input="{RESPONSE_Set_Cookie}" pattern="; secure" />
Это связано с тем, что WSFederation выполнит очистку куки-файлов без добавления безопасного флага и без безопасного флага, chrome игнорирует установленный запрос cook ie на удаление куки-файлов.
Вам больше ничего не нужно делать, например очищать / устанавливать файлы cookie вручную, просто используйте метод SignOut (), предоставленный модулем WSFederationAuthenticationModule.