У меня есть все oop, которое проходит через модели. L oop генерирует несколько формул, которые вставляются в команду модели и затем обрабатываются для выбора шага назад, используя buildmer()
. Используя функцию lapply()
, он делает это для каждого фрейма данных в списке под названием «Виды». Проблема в том, что мне нужно хранить результаты в разных фреймах данных, чтобы не перепутать их.
Упрощенный пример кода:
lapply(Species, function(x){
for (i in 1:10){
LRm<-buildmer(formula = form.LR, family = 'binomial', control=glmerControl(optimizer="bobyqa"), data=x, crit= c('AIC'), direction = c("order", "backward"))
#Get the species name for current model
ID<-colnames(DIKDIK) %>%
.[grepl("ADULTS",.)]%>%
sub("*.ADULTS", "", .)
paste0(ID)$AIC[i]<-AIC(LRm)
}
})
РЕДАКТИРОВАТЬ: form.LR формула модели, которая создается заново для каждой итерации, но этот код опущен, поскольку он не имеет значения
. Становится очевидным, что, когда код достигает второго значения для x (то есть запускает модель для второго фрейма данных ) результаты будут перезаписаны из результатов первого, поскольку используются те же индексы для «i». В этом и заключается проблема.
Обратите внимание, что я могу определить, какой фрейм данных использовался, выбрав имя столбца с частичным соответствием «ВЗРОСЛЫМ», используя grepl()
, для которого полное имя столбца уникально в каждом фрейме данных. Поэтому я подумал, что могу назвать каждый фрейм данных этой строкой, то есть «GIRAFFE», и использовать его для определения места хранения данных. Но я не могу найти правильную комбинацию paste()
. И я даже не уверен, возможно ли то, что я пытаюсь сделать.
Текущий код не работает, выдавая ошибку
Error in paste0(ID)[[i]] <- NA : could not find function "paste0<-"
Я не нашел других решений подобных проблем на SO уже.
Упрощенный воспроизводимый пример объекта списка видов будет
ADULTS.GIRAFFE<-rnorm(20, 3, sd=1)
ADULTS.DIKDIK<-rnorm(20, 3, sd=1)
ADULTS.IMPALA<-rnorm(20, 3, sd=1)
presence1<-rbinom(20, 1, .5)
presence2<-rbinom(20, 1, .5)
presence3<-rbinom(20, 1, .5)
var1<-rnorm(20, 3, sd=1)
var2<-rnorm(20, 3, sd=1)
var3<-rnorm(20, 3, sd=1)
a<-cbind(presence1, var1, var2, var3, ADULTS.GIRAFFE)
b<-cbind(presence1, var1, var2, var3, ADULTS.DIKDIK)
c<-cbind(presence1, var1, var2, var3, ADULTS.IMPALA)
Species<-list(a,b,c)