Проверьте, не установлен ли WEBSITE_RUN_FROM_PACKAGE на «1» в настройках приложения. Этот параметр не извлекает содержимое пакета в каталог D: \ home \ site \ wwwroot вашего приложения. Вместо этого он загружает ZIP-файл как есть в D: \ home \ data \ SitePackages и создает файл packagename.txt в том же каталоге, который содержит имя ZIP-пакета для загрузки во время выполнения.
См .: docs.microsoft.com/en-us/azure/app-service/deploy-run-package