$ awk '{printf "%s\047%s\047", sep, $0; sep=","} END{print ""}' file
'file1.gz','file2.gz','file3.gz','file4.gz'
или эквивалентная функциональность, но сохраняющий весь входной файл в памяти:
$ awk '{out=out sep "\047" $0 "\047"; sep=","} END{print out}' file
'file1.gz','file2.gz','file3.gz','file4.gz'
и сокращенно для игроков в гольф: -):
$ awk -v q="'" '{o=o s q $0 q; s=","} END{print o}' file
'file1.gz','file2.gz','file3.gz','file4.gz'
Лично я бы используйте первый скрипт выше, если у вас нет определенной c необходимости создать всю выходную запись перед печатью, например, чтобы каким-то образом изменить ее на основе многострочного регулярного выражения.