Если вы пишете «100% чистый Python», вы можете делать все, что CPython может делать в IronPython. Проблема возникает, когда вы хотите использовать сторонний пакет. Многие из них написали свои части с высокой производительностью на C и полагаются на API Python / C (например, NumPy).
В качестве связующего языка для объединения компонентов .NET IronPython великолепен.