Прежде всего, я бы предложил отключить плагин Material Theme UI и перезапустить IDE. Этот плагин довольно сильно изменяет GUI битов и иногда вызывает случайные проблемы в разных областях, которые в противном случае отсутствуют.
Я не говорю «отключить его навсегда», но, по крайней мере, просто для проверки и подтверждения если это будет иметь какое-либо значение.
В любом случае возможными обходными путями являются:
Попробуйте изменить размер фактического окна настроек (нижний правый угол) - сделать увеличенный размер должен сделать раздел с элементами управления снова видимым.
Попробуйте установить нужные параметры для JavaScript, а затем переключитесь на другую страницу настроек (например, HTML или просто стиль кода). ), где эти элементы управления уже видны.
Кнопки «Применить» / «ОК» влияют на все настройки, а не только на видимую в данный момент страницу настроек.