Атрибут nil задокументирован здесь .
С точки зрения сериализации Java-объекта он позволяет атрибуту объекта иметь значение NULL и при этом оставаться действительным документом XML. Это стандартный способ представления объектов Java в схеме XML, поскольку атрибуты объектов не обязательно заполнять в Java.
Если вы хотите больше контроля над WSDL, вам следует рассмотреть возможность использования чего-то вроде JAXWS. Проблема здесь в том, что поддержка этой технологии в Axis2 не очень развита, и, на мой взгляд, ее сложнее развернуть.
Если вы хотите получить абсолютный контроль над WSDL (используя его в качестве спецификации интерфейса), вероятно, лучше использовать его для генерации кода Java, а не надеяться, что ваш java будет соответствовать чьей-либо спецификации.