Я не знаю много о docker. Вот мои заметки по установке XDebug в Ubuntu 18.04 (в HyperV VM) для PhpStorm. Могут быть некоторые ошибки, но это сработало для меня.
apt install php-xdebug
##### Ubuntu Server #####
mkdir -p /var/log/xdebug
touch /var/log/xdebug/xdebug.log
chown -R www-data:www-data /var/log/xdebug
nano /etc/php/7.2/mods-available/xdebug.ini
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# The default value for zend_extension is enough. But if you want to change, go to /usr/lib/php/ and find latest folder with xdebug.so (in my case '20180731') and make full path to provide in zend_extension #
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xdebug.default_enable = 1
xdebug.remote_enable = 1
xdebug.remote_port = 9000
xdebug.remote_connect_back = 1
xdebug.idekey = PHPSTORM
xdebug.remote_log = /var/log/xdebug/xdebug.log
;zend_extension=/usr/lib/php/20180731/xdebug.so
;xdebug.remote_host = 127.0.0.1
;xdebug.remote_autostart = 1
;xdebug.remote_handler = dbgp
;xdebug.remote_mode = req
systemctl restart apache2