Это функция для нахождения всех самых длинных общих последовательностей для последовательностей X и Y. Но эта программа на c ++, но я хочу написать ее на C.
Есть ли способ использовать массив вместо набора?
Например. если входное значение равно
X = < A, A, T, C, C, >
Y = < A, C, A, C, G, >
, то выходное значение должно быть
< A, C, C, >
< A, A, C, >
m и n - размеры последовательности X и Y соответственно.
/* source : https://www.geeksforgeeks.org/printing-longest-common-subsequence-set-2-printing/ */
/* Returns set containing all LCS for X[0..m-1], Y[0..n-1] */
set<string> findLCS(string X, string Y, int m, int n)
{
// construct a set to store possible LCS
set<string> s;
// If we reaches end of either string, return
// a empty set
if (m == 0 || n == 0)
{
s.insert("");
return s;
}
// If the last characters of X and Y are same
if (X[m - 1] == Y[n - 1])
{
// recurse for X[0..m-2] and Y[0..n-2] in
// the matrix
set<string> tmp = findLCS(X, Y, m - 1, n - 1);
// append current character to all possible LCS
// of substring X[0..m-2] and Y[0..n-2].
for (string str : tmp)
s.insert(str + X[m - 1]);
}
// If the last characters of X and Y are not same
else
{
// If LCS can be constructed from top side of
// the matrix, recurse for X[0..m-2] and Y[0..n-1]
if (L[m - 1][n] >= L[m][n - 1])
s = findLCS(X, Y, m - 1, n);
// If LCS can be constructed from left side of
// the matrix, recurse for X[0..m-1] and Y[0..n-2]
if (L[m][n - 1] >= L[m - 1][n])
{
set<string> tmp = findLCS(X, Y, m, n - 1);
// merge two sets if L[m-1][n] == L[m][n-1]
// Note s will be empty if L[m-1][n] != L[m][n-1]
s.insert(tmp.begin(), tmp.end());
}
}
return s;
}