Настройки сортировки папок сохраняются в:
HKCU\Software\Classes\Local Settings\Software\Microsoft\Windows\Shell\Bags\
HKCU\Software\Classes\Local Settings\Software\Microsoft\Windows\Shell\BagMRU
Записи выглядят следующим образом:
![enter image description here](https://i.stack.imgur.com/vCuQD.png)
Вам потребуется l oop через все эти записи реестра и изменить ключ 'Sort'. Это повлияет только на папки, к которым уже получен доступ.
Если вы хотите увидеть, как эти списки анализируются, запустите ShellBagsView при запуске ProcMon и зарегистрируйте все взаимодействия с реестром.
Чтобы сделать это, не программно, вы можете следовать этим инструкциям: https://superuser.com/a/1481763/1043059