У меня есть RasterStack в R, называемый "preds2", который равен 4,1 ГБ и был выведен из 4 RasterStacks и 2 RasterLayers (wveg, wfps_lag, wfps, ndvi, swt, lu):
cl <- makeCluster(4)
registerDoSNOW(cl)
preds<-foreach(j = 1:nlayers(ndvi))%dopar%{
library(raster)
library(SpaDES)
time <- stack(wveg,wfps_lag[[j]],wfps[[j]],ndvi[[j]],swt[[j]],lu)
names(time) <- c('wveg','wfps_lag','wfps','ndvi','swt','lu')
exp(raster::predict(time,m,const=fact_table,exclude=c("s(wlch)","s(wetid)")))
}
stopCluster(cl)
preds2<-stack(preds)
> preds2
class : RasterStack
dimensions : 6617, 11771, 77888707, 27 (nrow, ncol, ncell, nlayers)
resolution : 0.0002694946, 0.0002694946 (x, y)
extent : -95.69591, -92.52369, 41.71803, 43.50128 (xmin, xmax, ymin, ymax)
crs : +proj=longlat +datum=WGS84 +no_defs +ellps=WGS84 +towgs84=0,0,0
names : layer.1, layer.2, layer.3, layer.4, layer.5, layer.6, layer.7, layer.8, layer.9, layer.10, layer.11, layer.12, layer.13, layer.14, layer.15, ...
min values : 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, ...
max values : 0.001754114, 0.001754114, 0.001754114, 0.001754114, 0.001730909, 0.001601078, 0.081421784, 3.510447853, 5.134697329, 7.547881571, 10.945457688, 13.332227330, 14.864517447, 16.708383138, 16.631466329, ...
I я пытаюсь записать этот RasterStack в файл .tif, но получаю ошибку:
> writeRaster(stack(preds3), filename = "C:\\Users\\RL\\Documents\\preds.tif", options="INTERLEAVE=BAND", overwrite=TRUE)
Error in file(fn, "rb") : cannot open the connection
In addition: Warning message:
In file(fn, "rb") :
cannot open file 'C:\Users\RL\AppData\Local\Temp\RtmpeegnBN\raster\r_tmp_2020-04-25_004109_2364_37231.gri': No such file or directory
Та же ошибка при использовании calc
и для объекта "preds2". Ранее я создавал гораздо меньшие RasterStacks с этим кодом без каких-либо проблем. Онлайн-блоги и документация предполагают, что эта ошибка может быть связана с тем, что это такой большой RasterStack (например, предложение по сохранению «preds2» как rasterTmpFile
, но я все еще получаю ту же ошибку при чтении временного файла). Предложения с кодом (как я новичок в R) будет принята с благодарностью. Спасибо!