Вы определили CMAKE_TOOLCHAIN_FILE как vcpkg. Если эта переменная определена, dar knet по умолчанию будет думать, что вы сконфигурировали pthread_window в vcpkg (это происходит примерно в 30-40 строках в CMakeLists.txt), но на самом деле это не так. Таким образом, вам нужно заменить
if(WIN32 AND NOT DEFINED CMAKE_TOOLCHAIN_FILE)
set(USE_INTEGRATED_LIBS "TRUE" CACHE BOOL "Use libs distributed with this repo")
else()
set(USE_INTEGRATED_LIBS "FALSE" CACHE BOOL "Use libs distributed with this repo")
endif()
на
set(USE_INTEGRATED_LIBS "TRUE" CACHE BOOL "Use libs distributed with this repo")
Это позволит dar knet использовать собственные сторонние потоки в каталоге root.