Я думаю, что вы спрашиваете: «Можно ли использовать knotify для выполнения команды, когда kmail получает почту с темой Foo?»
Нет, но вы можете создать фильтр в Kmail, чтобы сделать то же самое. В разделе «Настройки»> «Настроить фильтры» вы сможете создать новый фильтр; в левом нижнем углу есть кнопка Справка, которая отображает все расширенные функции, в том числе способ передачи полученных электронных писем через внешние приложения.
Если это не то, что вы ищете, вам нужно уточнить ваш вопрос.