Самый простой способ - перейти от использования SyleCop к использованию анализа кода, встроенного в VS2010.
Если вы должны использовать StyleCop, вам нужно, чтобы он работал как действие в рабочем процессе XAML, используемом во время сборки. Самый простой способ - создать действие, которое запускает StyleCop с параметрами в качестве параметров. Затем вы можете отобразить эти параметры в параметрах процесса в определении сборки.
Я бы проверил http://msbuildextensionpack.codeplex.com/