pamr: Как я могу прочитать мой txt-файл без parm.from.excel?

Question

Я только начинаю использовать R. Я хотел использовать pamr, но я не могу прочитать свои данные. Я пытался использовать что-то вроде

 my.data <- pamr.from.excel("mydata.txt", 13, sample.labels=TRUE)

Произошла ошибка, в результате которой не удалось найти функцию "pamr.from.Excel". Читая Справочное руководство, я понял, что эта функция не существует в последней версии pamr. Как я могу прочитать мои данные?

Мне нужно что-то вроде этого: «Список с компонентами: x - гены выражения в строках, образцы в столбцах) и y - вектор меток классов для каждого образца. Optionalcomponents-genenames, avectorofgenenames, andgeneid-avector идентификаторов генов ". (см .: https://cran.r-project.org/web/packages/pamr/pamr.pdf)

Я надеюсь, что кто-нибудь может мне помочь.

Answer 1

Может показаться, что эта функция исчезла из пакета после версии 1.54.

Что вы можете сделать, это: а) установить более старую версию пакета, например, из GitHub, используя пакет remotes (потребуется сборка , так что вам нужно иметь соответствующий набор инструментов), б) использовать последнюю известную версию функции (т.е. скопировать / вставить ее в ваш собственный проект, код здесь ) или c) см. перед связанной функцией и импортирует данные вручную, эмулируя возвращенный объект (код из вышеупомянутой ссылки).

return(list(x = x, y = y, genenames = genenames, geneid = geneid, 
            samplelabels = samplelabels, batchlabels = batchlabels))