При создании портфеля в BeeWare у вас должен быть доступ администратора, поскольку он загружает и устанавливает пакеты. Эта проблема возникает из-за того, что портфель не может загрузить Wix Toolset и не может указать переменную среды Wix.
Вы можете вручную загрузить Wix Toolset отсюда https://wixtoolset.org/releases/ установить его и проверить свою среду переменные в системных переменных вы можете найти Wix.
Теперь попробуйте создать портфель после установки.