Я недавно установил еще один Python, не удаляя предыдущий, и теперь, когда я пытаюсь запустить свой скрипт из cmd, Windows подталкивает меня выбрать приложение, которое будет запускать py.script.
как указано в alex067, вы должны установить переменную PATH в ваших переменных среды.
Вы можете следовать инструкциям здесь https://superuser.com/questions/143119/how-do-i-add-python-to-the-windows-path