Это невозможно.
Единственное, что может повлиять на текущую среду процесса, - это сам процесс. Поскольку текущая оболочка bash, единственное, что может быть выполнено, что может повлиять на среду bash, - это то, что может запускаться самой bash. Этим «чем-то» являются утверждения, интерпретируемые bash. Поскольку bash не поддерживает интерпретацию и выполнение операторов python, это невозможно.
Обычный способ обойти это - вывести из сценария python правильно экранированные операторы присваивания, которые бы назначали среду переменные. Тогда вывод вашего скрипта будет eval
обработан bash. Вот, например, как eval "$(docker-machine ...)"
работает.