Как отобразить текст из цветного рисунка и легко читать в visNetwork? - PullRequest
Новая
       43

Как отобразить текст из цветного рисунка и легко читать в visNetwork?

1 голос
/ 16 марта 2020

Я получаю карту сети, используя R с библиотекой visNetwork, но я ненавижу, что отображаемая легенда содержит текст внутри фигуры, поэтому ее размер определяется тем, насколько велико имя, и я не хочу его будь таким образом, чтобы избежать путаницы. В библиотеке документация они добавляют фигуры, которые отображают текст снаружи, но вы должны установить его по группам с фрагментом visGroups (например, shape = "triangle") для каждой из групп, и я хочу это установить таким образом, чтобы я мог оставить этот кодовый набор, не зная точно, сколько групп они будут, потому что он не обязательно будет всегда одним и тем же числом.

Кодирование ниже - это то, что я использую (намного больше, упростив его, выбрав только несколько столбцов и строк): 

library(igraph)
library(visNetwork)


twd2 <- structure(c(0.0854374047081175, 0.116200039661793, 0.0289142580616779, 
                    0.12768720590989, 0.273786051264039, 0, 0.000593902599973604, 
                    0, 0.00184397276348455, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.106048390315551, 
                    0, 0, 0, 0.0142648455772593, 0, 0.0197857551361577, 0.0290239379534046, 
                    0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.00197967638677129, 0, 0.000296951299986802, 
                    0, 0.0111915576381184, 0, 0.00111081782587656, 0.0276104933163398, 
                    0, 0, 0.00487220095904272, 0.0149921777316026, 0, 0, 8.79855703664599e-05, 
                    0.00674104365369398, 0, 0, 0.0330935726540847, 0, 0, 0.0362094142674287, 
                    0, 0, 0, 0.00172168238114983, 0.00232061941841538, 0.0248983709144504
), .Dim = c(4L, 15L), .Dimnames = list(NULL, c("water_treatment", 
                                               "waste_water", "utility_model", "water_inlet", "waste_water_treatment", 
                                               "treatment_system", "model_discloses", "utility_model_discloses", 
                                               "water_outlet", "water_treatment_system", "treatment_device", 
                                               "water_tank", "sludge_treatment", "reverse_osmosis", "raw_water")))
twd2_num_col <- ncol(twd2)
twd2_cor <- cor(twd2, method = "pearson")
twd2_cor[ abs(twd2_cor) <  0.75 ] <- 0
twd2_cor[ abs(twd2_cor) >  0.925 ] <- 0
diag(twd2_cor) <- 0
graph <- graph.adjacency(twd2_cor, weighted=TRUE, mode="lower")
E(graph)$edge.width  <- E(graph)$weight
V(graph)$group       <- apply(twd2, 2, which.max)  # Max topic prob for colors
V(graph)$betweenness <- betweenness(graph, v = V(graph), directed = F)
V(graph)$degree      <- degree(graph, v = V(graph))

# Fit data for visNetwork
nm_data <<- toVisNetworkData(graph)
nodes <<- as.data.frame(nm_data[[1]], stringsAsFactors = F)
nodes <<- nodes[nodes$degree != 0,]    # Bye topics that don't have a connection (degree = 0)
nodes$group <<- swap(nodes$group , 1:length(topic_names), topic_names) # Swap long real names
nodes$label <<- rep("")


# Plot
  # Graph
  set.seed(17);visNetwork(as.data.frame(nodes, stringsAsFactors = F), 
                          as.data.frame(nm_data[[2]], stringsAsFactors = F), 
                          main = "Relation between topics")  %>%
    visOptions(highlightNearest = TRUE, selectedBy = "group") %>%
    visInteraction(dragNodes = FALSE) %>%
    visLegend(useGroups = TRUE, main = "Topic")  %>%
    visNodes(shape = "dot",label = NULL) %>%
    visIgraphLayout(randomSeed = 17)

Дополнительно, здесь они ссылаются на то, что я сказал вслух, выбирая тип фигур, но они не добавляют никакого кода, и я не могу понять, есть ли способ сделать это напрямую и применить его ко всем параметрам группы или любому другому выбору, который я мог бы есть.

...