Я работаю над пакетом, который использует data.table
внутри. В этом пакете у меня есть функция count_by
, которая вычисляет количество различных идентификаторов для определенной c переменной в data.table
по группам. С некоторой помощью ( R data.table: как передать «все возможное» в функцию? ) Я получил это для работы, как и ожидалось:
library(data.table)
#> Warning: package 'data.table' was built under R version 3.6.2
# create example data
sample_dt <- data.table(
id = sort(rep(LETTERS[1:3], 3)),
year = rep(2018L:2020L),
x = runif(9)
)
sample_dt[id == "B" & year < 2020, x := NA_real_]
# define inner function
count_by <- function(DT, id_var, val_var, by = NULL) {
id_var <- as.character(substitute(id_var))
val_var <- as.character(substitute(val_var))
eval(substitute(
DT[!is.na(get(val_var)), .(distinct_ids = uniqueN(get(id_var))), by = by]
))
}
# test inner function -> works as expected
(reference <- count_by(sample_dt, id_var = id, val_var = x, by = year))
#> year distinct_ids
#> 1: 2018 2
#> 2: 2019 2
#> 3: 2020 3
identical(count_by(sample_dt, "id", x, year) , reference)
#> [1] TRUE
identical(count_by(sample_dt, "id", "x", year) , reference)
#> [1] TRUE
identical(count_by(sample_dt, "id", x, "year") , reference)
#> [1] TRUE
identical(count_by(sample_dt, "id", x, c("year")) , reference)
#> [1] TRUE
identical(count_by(sample_dt, "id", "x", "year") , reference)
#> [1] TRUE
identical(count_by(sample_dt, "id", "x", c("year")), reference)
#> [1] TRUE
identical(count_by(sample_dt, id, "x", year) , reference)
#> [1] TRUE
identical(count_by(sample_dt, id, "x", "year") , reference)
#> [1] TRUE
identical(count_by(sample_dt, id, "x", c("year")) , reference)
#> [1] TRUE
identical(count_by(sample_dt, id, x, "year") , reference)
#> [1] TRUE
identical(count_by(sample_dt, id, x, c("year")) , reference)
#> [1] TRUE
Создано в 2020-02-20 пакетом Представить (v0.3.0)
Теперь я хотел бы использовать функцию count_by()
в другой функции (минимальный пример ниже):
# define wrapper function
wrapper <- function(data, id_var, val_var, by = NULL) {
data <- as.data.table(data)
count_by(data, id_var, val_var, by)
}
# test wrapper function
wrapper(sample_dt, id_var = id, val_var = x, by = year)
#> Error in .(distinct_ids = uniqueN(get("id_var"))): could not find function "."
Создано в 2020-02-20 пакетом Представить (v0.3.0)
Отладка count_by()
привести к Обратите внимание, что если count_by()
вызывается из wrapper()
, substitute(DT[...])
также заменяет DT
на data
:
Browse[2]> substitute(
+ DT[!is.na(get(val_var)), .(distinct_ids = uniqueN(get(id_var))), by = by]
+ )
data[!is.na(get("val_var")), .(distinct_ids = uniqueN(get("id_var"))),
by = by]
Поскольку data
недоступно в функциональной среде count_by()
оно оценивается как utils::data
, что затем приводит к ошибке. Это проясняет проблему, но я не могу придумать решение.
Мне нужно подставить целое выражение DT[...]
, чтобы by
работал правильно (см. R data.table: Как передать «все возможное» в функцию? или передача переменных и имен в функцию data.table ). Но я не могу заменить все выражение так, чтобы DT
не заменялось.
Каково решение этой дилеммы?