К сожалению, мне не удалось заставить пейджинг работать с наборами форм.
Вместо этого я расширил BaseInlineFormSet и изменил метод get_queryset, чтобы он возвращал только подмножество объектов, которые необходимо было отредактировать, и установил ограничение на максимальное количество возвращаемых объектов. Поэтому, когда пользователь хочет редактировать связанные объекты, он может редактировать только заданное количество объектов одновременно, например, 20 из 60 возможных. Когда пользователь завершит редактирование первых 20 и отправит форму, будут отображены следующие 20.