Ссылка на схему используется для стандартных элементов XAML, которые компилятор знает, как отобразить непосредственно во встроенные классы WPF.
Ссылка на пространство имен CLR - это подсказка для компилятора, который, по-видимому, и пространство имен следует искать при сопоставлении элементов XML в вашем пространстве имен пространства имен с классами CLR / WPF.