Сбой в loding библиотеки r Java в R на MacOs - PullRequest
Новая
       26

Сбой в loding библиотеки r Java в R на MacOs

0 голосов
/ 17 марта 2020

После обновления новых MacO, система добавляет новую предпочтительную оболочку zsh., Если у вас есть проблемы с оболочкой, такие как напоминание о необходимости переключения bu sh или zsh в начале терминала, обратитесь к https://www.theverge.com/2019/6/4/18651872/apple-macos-catalina-zsh-bash-shell-replacement-features

Для ошибки r Java, с которой я столкнулся после обновления системы, у многих людей возникает такая же проблема, как 

    Error: package or namespace load failed for ‘rJava’:
     .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
      call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
      error: unable to load shared object '/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.6/Resources/library/rJava/libs/rJava.so':
      dlopen(/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.6/Resources/library/rJava/libs/rJava.so, 6): Library not loaded: /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk-11.0.1.jdk/Contents/Home/lib/server/libjvm.dylib
      Referenced from: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.6/Resources/library/rJava/libs/rJava.so
      Reason: image not found

, и она не может быть запущена sudo R CMD javareconf для сброса пути.

1 Ответ

0 голосов
/ 17 марта 2020

Эта топика c уже обсуждалась в (https://github.com/rstudio/rstudio/issues/2254), а базовый c подход к решению этой проблемы - в (https://zhiyzuo.github.io/installation-rJava/)

Однако этот пост немного устарел и неприменим для новой системы ma c.

Лично вам нужно установить функцию «Доморощенный» на терминале с помощью 

    ~$ /usr/bin/ruby -e "$(curl -fsSL https://raw.githubusercontent.com/Homebrew/install/master/install)

На следующем шаге вам нужно установить brew и g cc, но помните, что вам нужно установить g cc 7.2.0. для этого вам нужно набрать это в терминале 

~$ brew install gcc@7

и переименовать материнскую папку в g cc, а также изменить имя внутренней папки на 7.2.0, чтобы путь был `/ usr / local / Cellar / g cc '(Command + Shift + Dot для отображения скрытой папки)

Вам необходимо установить Java SE Development Kit 11.0.1, чтобы соответствовать r Java. ссылка (https://www.oracle.com/java/technologies/javase/jdk11-archive-downloads.html) поиск 11.0.1 на странице, и вы можете скачать его, без указания c требование для Java вы можете скачать обновленный здесь (https://www.oracle.com/java/technologies/javase-downloads.html )

После установки java вы можете начать с шага 4 для инструкции (https://zhiyzuo.github.io/installation-rJava/) и после того, как вы все это сделаете, не забудьте запустить sudo R CMD javareconf для перенастроить R

...