Выдавать изменяющиеся точки (заливка и форма) на карте, используя ggplot и geom_sf - PullRequest
1 голос
/ 27 апреля 2020

Используя ggplot2 (v 3.2.1) и sf (v. 0.7-7), я могу легко построить карту моих необработанных данных с цветными точками в выбранной форме, без проблем:

  P1 <- ggplot() +
  geom_sf(data = Map.nb) +
  geom_sf(data = Df_raw, shape = 22, size = 2, fill = 'purple') +
  theme_bw()

enter image description here В приведенных выше необработанных данных каждое местоположение имеет несколько рядов данных (например, три ловушки на сайт). Я создаю второй фрейм данных, суммирующий данные для каждого сайта, используя dplyr (v. 0.8.3)

Df.summarize <- Df_raw %>%
  group_by(plot_id) %>% 
  summarise(moth_per_plot = sum(moth_count), traps = n_distinct(trap)) %>% 
  mutate (avg_moth_per_trap = moth_per_plot/traps)

Если я строю обобщенные данные, они отображаются нормально, но я не могу изменить форму или заполнение точки.

P2 <- ggplot() +
  geom_sf(data = Map.nb) +
  geom_sf(data = Df.summarize, shape = 22, size = 2, fill = 'purple') +
  theme_bw()

enter image description here Как ни странно, если я заменю fill = 'purple' на col = 'purple' контур точек изменит цвет (как и ожидалось). Я в недоумении, почему я могу изменить col, но не fill или shape.

Кто-нибудь знает, как я могу изменить заполнение и форму в моем графике обобщенных данных? Или есть какое-то объяснение, почему это работает с моими необработанными данными, но не для сводных данных?

Примечание: class(Df.summarize) - это 'sf', 'tbl_df', 'tbl' & 'data.frame' class(Df.raw) - это 'sf' & 'data.frame'

I ' мы преобразовали класс Df.summarize в соответствие Df.raw, но это не помогает.

Редактирование str() каждого фрейма данных:

str(Df_raw)
Classes ‘sf’ and 'data.frame':  390 obs. of  3 variables:
 $ plotid    : chr  "4592 6665" "4566 6698" "4546 6653" "4571 6617" ...
 $ moth_count: num  22 41 4 20 129 1 8 2 95 35 ...
 $ SHAPE     :sfc_POINT of length 390; first list element:  'XY' num  2487757 7436473
 - attr(*, "sf_column")= chr "SHAPE"
 - attr(*, "agr")= Factor w/ 3 levels "constant","aggregate",..: NA NA
  ..- attr(*, "names")= chr  "plotid" "moth_count"


str(Df_summarized)
Classes ‘sf’, ‘tbl_df’, ‘tbl’ and 'data.frame': 156 obs. of  5 variables:
 $ plotid           : chr  "4538 6587" "4538 6715" "4545 6561" "4546 6653" ...
 $ moth_per_plot    : num  7 135 17 12 2 18 59 152 13 19 ...
 $ traps            : int  3 3 2 2 2 3 3 3 3 3 ...
 $ SHAPE            :sfc_GEOMETRY of length 156; first list element:  'XY' num [1:3, 1:2] 2548882 2548899 2548920 7376785 7376824 ...
 $ avg_moth_per_trap: num  2.33 45 8.5 6 1 ...
 - attr(*, "sf_column")= chr "SHAPE"
 - attr(*, "agr")= Factor w/ 3 levels "constant","aggregate",..: NA NA NA NA
  ..- attr(*, "names")= chr  "plotid" "moth_per_plot" "traps" "avg_moth_per_trap"
...