Как визуализировать кластер с определенным эпсилоном при применении анализа топологических данных ripsDiag в R? - PullRequest
0 голосов
/ 20 февраля 2020

Мы пытаемся применить алгоритм ripsDiag в R для анализа следующего кластера

Мы нашли оптимальный эпсилон (или диапазон вокруг каждой точки) и хотим визуализировать различные кластеры, используя этот эпсилон, но мы не можем понять, как.

Как мы это делаем? Есть ли простой алгоритм для этого?

пока это наш код (с m1 в качестве нашей кластерной матрицы)

maxdim = 1
maxscale = 1300
RD = ripsDiag(m1, maxdim, maxscale, dist = "euclidean", library = "GUDHI", location = FALSE, printProgress = FALSE)
plot(RD$diagram, barcode=TRUE, main='Barcode')
abline(v=1202.3, col=3)
...