Я так не думаю.
Вы можете увидеть, есть ли у него символы отладки, что означает, что использовалась опция -g;) Но я не могу придумать, каким образом вы могли бы узнать, какие каталоги использовались для поиска включаемых заголовков, например.
Возможно, лучший ответ возможен, если вы нацелены только на определенный флаг; например если вы хотите знать, был ли установлен флаг "..." при компиляции этого двоичного файла или нет. В таком случае, что это за флаг?