нормализация микрочипа rma - текстовый файл - PullRequest
0 голосов
/ 20 февраля 2020

Интересно, как создать класс AffyBatch, имеющий только текстовый файл. У меня нет файла для аннотаций (поэтому я бы предпочел создать его вручную). Я сталкивался с командой AB <- new ("AffyBatch", exprs = exprs, cdfName = cdfname, phenoData = phenoData, ...), но у меня проблема с cdfName. Я пробовал cdfName = NULL, а также аннотацию cdfName =, но ни одна из них не сработала. </p>

Пожалуйста, кто-нибудь может указать мне более подробный пример, как это сделать? Мне нужно сделать нормализацию RMA и для этого мне нужно создать AffyBatch.

regards,

...