Вы можете сделать это примерно так, у вас есть несколько переменных, которые не требовались, поэтому я очистил код.
val score = Array(2) { 0 }
val aliceNumbers = readLine()!!.split(" ").map(String::toInt)
val bobNumbers = readLine()!!.split(" ").map(String::toInt)
require(aliceNumbers.size == 3 && bobNumbers.size == 3) { "There must be 3 numbers for each" }
require(!aliceNumbers.any { it !in 1..100 } || !bobNumbers.any { it !in 1..100 }) { "Numbers must be in range 1 to 100" }
for (a in 0..2) {
if(aliceNumbers[a] > bobNumbers[a]) score[0] += 1
if(aliceNumbers[a] < bobNumbers[a]) score[1] += 1
}
println("${score[0]} ${score[1]}")