Я бы посоветовал вам взглянуть на Учебник по PHP Ajax :)
Существует несколько способов создания флажков:
С PHP:
echo '<input type="checkbox" name="whatever" />';
// and son on
С помощью сценария Ajax:
Вы можете просто получить ответ ajax, содержащий необработанные html флажки.
С Javascript:
var chk = document.createElement("input");
chk.setAttribute("type", "checkbox");
var frm = document.forms[0];
frm.appendChild(chk);
// and on on........
Но все эти вещи кажутся вам новыми, сначала вы должны прочитать Учебник PHP Ajax .