Если '.a'
имена и '.b'
имена не требуют одинаковой замены / действия, например, добавив _new в конец, вы можете использовать reduce2
library(tidyverse) # dplyr + purrr for reduce2
df <- data.frame(one.a = 1, one.d = 2, twoa = 3, two.b = 4, three.a = 5)
df
# one.a one.d twoa two.b three.a
# 1 1 2 3 4 5
df %>%
rename_all(~ reduce2(c('\\.a$', '\\.b$'), c('.a_new1', '.b_new2'),
str_replace, .init = .x))
# one.a_new1 one.d twoa two.b_new2 three.a_new1
# 1 1 2 3 4 5