Есть плагин, который уже делает это:
<plugin>
<groupId>it.ozimov</groupId>
<artifactId>yaml-properties-maven-plugin</artifactId>
<version>1.1.3</version>
<executions>
<execution>
<phase>initialize</phase>
<goals>
<goal>read-project-properties</goal>
</goals>
<configuration>
<files>
<file>src/main/resources/application.yml</file>
</files>
</configuration>
</execution>
</executions>
</plugin>
С этого момента вы можете использовать любое из свойств application.yml
в самом pom, например:
${spring.datasource.url}
или ${spring.datasource.password}