Я использую вычислительный кластер CentOS 7 Linux с оперативной памятью 130 ГБ. Я пытаюсь использовать функцию SVM из пакета e1071 R. Размер моей матрицы: строки = 350 и столбцы = 54250.
Код сценария R (file_testR.R)
matris=matrix(rnorm(100),350,54251)
matris <- as.data.frame(matris)
matris$new_variable <- 0
matris$new_variable[1:175] <- "yes"
matris$new_variable[176:350] <- "no"
require(e1071)
svmfit_test <- svm(as.factor(matris$new_variable)~., data = matris, kernel = "linear", cross=10)
Bash код
Rscript --max-ppsize=500000 file_testR.R
Я получаю следующее сообщение об ошибке:
Error in model.matrix.default(Terms, m) :
long vectors not supported yet: ../../src/include/Rinlinedfuns.h:522
Calls: svm ... svm.formula -> model.matrix -> model.matrix.default
Буду признателен, если кто-нибудь поможет мне разобраться в этой проблеме.