Разобрать несколько полей. json в файл .txt на одинаковые строки - PullRequest
1 голос
/ 07 апреля 2020

Я использую jq для разбора файла. json в текстовый файл.

Я использовал:

jq -r '.[] | .file_id, .cases[].project.project_id' my_file.json > test6.tx

и получил файл, который выглядит следующим образом:

d47c1aaa
SKCM
5b8564e3
CESC
9b0b7bb0
GBM

Однако я хочу, чтобы это выглядело так

d47c1aaa  SKCM
5b8564e3  CESC
9b0b7bb0  GBM

Как мне это сделать?

1 Ответ

1 голос
/ 08 апреля 2020

Я понял это, но я опубликую здесь, если у кого-то возникнет тот же вопрос:

jq -r '.[] | "\(.file_id) \(.cases[].project.project_id)"' all_somatic_annotated_TCGA.json > test.txt
...